Slechts enkele dagen na het einde van de burgeroorlog werd president Abraham Lincoln vermoord in Ford's Theatre. Terwijl een gebroken natie rouwde, kwam een klopjacht op zijn moordenaar, de zesentwintigjarige acteur John Wilkes Booth, terecht. The Assassination of Abraham Lincoln volgt de convergerende paden van de president en zijn moordenaar, en legt vervolgens verbanden tussen hun laatste reizen, in de vorm van Lincoln's begrafenistreinroute en Booth's wanhopige pogingen om te ontsnappen.